由于人工改良的神仙鱼品种相当多，因此有时可能也会引发种类分辨上的困难，但是您却有更多的选择去饲养自己喜欢的样式或品系。通常人工改良的神仙鱼种的分类，可依尾鳍、条纹、色彩或鳞片之变化。 从花色上分。目前在国内比较常见的有：白神仙鱼、钻石神仙、黑神仙（墨燕儿）、金丝墨燕儿、灰神仙、黑白神仙、熊猫神仙、斑马神仙、云石神仙、半黑神仙、鸳鸯神仙、三色神仙、红头神仙、金头神仙、红眼神仙、玻璃神仙、埃及神仙等等。
在此基础上，上述每个种类又都同时具备下列特征，从而又演变出了更多的品类：
1、按形状分，上述每个品类又能分为短尾、中长尾、长尾三大品系；诸如长鳍XX神仙或短鳍XX燕儿等，例如：长（短）鳍斑马燕儿，长（短）鳍墨燕儿等。
2、按体型大小，上述每个品类还可以分为“神仙鱼”和“大神仙鱼”，成鱼身体长度在15公分以下的称为神仙鱼，15公分以上的称为“大神仙鱼”，例如：大熊猫神仙、大云石燕儿等。
3、按是否透明分，上述每个品类又能分为玻璃XX燕儿，例如：玻璃红眼神仙，玻璃金头燕儿等。
4、按眼睛分，上述每个品类又能分为红眼XX神仙或红眼XX燕儿，例如：红眼钻石燕儿，红眼云石燕儿等。
5、按头部是否红色或金色分，上述每个品类又能分为：红头XX燕儿（神仙）或金头XX神仙（燕儿）例如：红头熊猫燕儿（三色神仙），红头玻璃燕儿等。
6、按头部、眼睛是否都是红色分，上述每个品类还可以分为红头、红眼XX燕或红头、红眼XX神仙，例如：红头、红眼钻石燕儿，红头、红眼熊猫神仙等。